В 1932 г., после ФЗУ, в котором проучился 2 года (1930—1932), он сдал вступительные экзамены и стал студентом Ленинградского университета — такую подготовку обеспечило фабрично-заводское училище того времени: стране нужны были не только умелые, квалифицированные, технически грамотные, но и на уровне средней школы образованные рабочие. После успешного завершения пятилетнего обучения в университете А. А. Миклухо-Маклай — студент с такой знаменитой и завораживающей легендарной многообразной деятельностью своего далекого родственника фамилией стал аспирантом геологического факультета. Завершить аспирантуру и вовремя защитить диссертацию не дала война. В 1941—1942 гг. — он на оборонных работах и выполняет обязанности инженера-геолога. Затем — в 1942— 1945 гг. — воин на Западном, Калининградском, 1-м Прибалтийском, 1-м и 3-м Белорусском фронтах. Ходил в разведку и атаки... С орденом Красной Звезды, двумя медалями «За боевые заслуги», медалями «За отвагу», «За взятие Кенигсберга» и «За победу над Германией» А. Д. Миклухо-Маклай после Победы возвратился в университет.
Год проработал заместителем директора и научным сотрудником Института земной коры, но затем перешел на преподавательскую работу, став ассистентом кафедры исторической геологии геологического факультета. Вскоре — в 1947 г. — защитил кандидатскую диссертацию, получил звание доцента и в такой должности проработал до 1962 г. В 1961 г. защитил докторскую диссертацию и стал профессором той же кафедры. Он — автор более 130 научных трудов. «Наряду с учебной работой, — отмечало руководство факультета, — А. Д. Миклухо-Маклай непрерывно проводил крупные научно-геологические исследования, сочетая их с решением практических задач». Его ценили как одного из крупнейших специалистов страны по верхнему палеозою. С 1962 г. он руководил комиссией межведомственного стратиграфического института СССР, вместе с геологами среднеазиатских республик вел многолетние исследования верхне-палеозойских отложений на территории этих республик, оказывал большую помощь геологическим организациям других республик и городов России. Его большая и плодотворная работа, направленная на содружество науки с производством, была особо отмечена в приказах ректора университета, а изданная монография в 1965 г. была отмечена Первой университетской премией. В 1961 г. А. Д. Миклухо-Маклай был награжден медалью «За трудовую доблесть».
А. Д. Миклухо-Маклай активно участвовал в общественной жизни университета и факультета — был членом профсоюзного комитета факультета и комиссии партийно-государственного контроля университета, хотя и не был членом партии. Он несколько раз избирался в состав комиссий по выборам в местные Советы.
К сожалению, активная и плодотворная деятельность А. Д. Миклухо-Маклая прервалась его довольно ранней смертью — ему не было и 51 года.
Бережной А.Ф. Они сражались за Родину: Универсанты в годы войны и в послевоенные годы. Вып. 3. СПб.: Издательство С.-Петербургского университета, 1997. С. 80-81.