Призванный в 1939 г. в ряды Красной Армии, он еще до Великой Отечественной войны закончил специальное военное училище летчиков. В качестве сержанта-пилота в составе авиационного полка ночных бомбардировщиков Белорусского фронта сражался всю войну. Особенно запомнилась операция по форсированию реки Одер в районе города Кюстрина.
Демобилизовался В. С. Козлов младшим лейтенантом. В мастерские физического факультета университета пришел в 1981 г.
Его участие в Великой Отечественной войне отмечено орденом Отечественной войны и медалями. В университете удостоен медали «Ветеран труда».
Бережной А.Ф. Они сражались за Родину: Универсанты в годы войны и в послевоенные годы. Вып. 4. СПб.: Изд-во С.-Петербургского университета, 2003. С. 52-53.