Великая Отечественная война застала его на третьем курсе математико-механического факультета. До августа 1941 г. вместе с тысячами ленинградцев он трудился на оборонных работах под городом, но затем его направили в автотранспортное училище. После него, до прорыва блокады, И. П. Мысовских принимал участие в боях на Ленинградском фронте. После — оказался в понтонных частях Украинского фронта. Двигаясь вперед, форсируя Днепр, Днестр, Вислу, Эльбу, Нейсе и Шпрее, понтонщик дошел до Берлина и Праги. Всю войну И. П. Мысовских провел рядовым, но к концу войны грудь его украшали орден Красной Звезды и Отечественной войны, медали «За оборону Ленинграда», «За освобождение Праги», «За победу над Германией» и др.
После демобилизаци завершил учебу на своем факультете, а дальше — по всем ученым и преподавательским «ступеням», вплоть до профессора кафедры вычислительной математики математико-механического факультета, активной научной работы.
Бережной А.Ф. Они сражались за Родину: Универсанты в годы войны и в послевоенные годы. Вып. 4. СПб.: Изд-во С.-Петербургского университета, 2003. С. 79.